1. Alrijne.nl
  2. Teamleden
  3. dr. J.A. (Jurgen) Kooren

dr. J.A. (Jurgen) Kooren

Na het behalen van mijn doctoraal examen Biologie (cum laude, universiteit Leiden) ben ik gepromoveerd aan het ErasmusMC in Rotterdam bij de afdeling Celbiologie en genetica (prof.dr. F. Grosveld). Hier heb ik enkele jaren basaal wetenschappelijk onderzoek gedaan naar de 3-dimensionale DNA structuur van het beta-globine genlocus. Dit gen is betrokken bij de totstandkoming van hemoglobine; het belangrijkste eiwit in rode bloedcellen voor het transport van zuurstof en koolstofdioxide van en naar de organen. Dit onderzoek resulteerde in 2007 in het proefschrift: “Nuclear organization and higher order chromatin structure of the beta globin locus”

Vervolgens ben ik in 2008 bij Atalmedial opgeleid tot klinische chemicus en ben ik sinds 2012 werkzaam als geregistreerd klinisch chemicus bij Atalmedial. Op dit moment ben ik als klinisch chemicus verantwoordelijk voor de uitvoering van diverse hematologie analyses (van het meten van het hemoglobine-gehalte in bloed tot het bekijken van bloedcellen onder de microscoop). Ook ben ik vakinhoudelijk verantwoordelijk voor het uitvoeren en interpreteren van moleculair biologische (DNA) testen, met name voor het vakgebied van de hematologie. Het klinisch chemisch laboratorium kent een sterke automatiseringsgraad. Vanuit onze Wetenschappelijke staf ben ik het primaire aanspreekpunt op het gebied van laboratoriumautomatisering en ICT-oplossingen voor zowel Atalmedial als onze klanten (waaronder het Alrijne ziekenhuis).

Aandachtsgebieden

Hematologie, Moleculaire diagnostiek, Laboratoriumautomatisering

Proefschrift

“Nuclear organization and higher order chromatin structure of the beta globin locus”

Lidmaatschappen

Nederlandse Vereniging voor Klinische Chemie en Laboratoriumgeneeskunde                                 

Publicaties

  • Discordant signaling and autophagy response to fasting in hearts of obese mice: Implications for ischemia tolerance. Andres AM, Kooren JA, Parker SJ, Tucker KC, Ravindran N, Ito BR, Huang C, Venkatraman V, Van Eyk JE, Gottlieb RA, Mentzer RM Jr. Am J Physiol Heart Circ Physiol. 2016 Jul 1;311(1):H219-28. 
  • Metaproteomic analysis using the Galaxy framework. Jagtap PD, Blakely A, Murray K, Stewart S, Kooren J, Johnson JE, Rhodus NL, Rudney J, Griffin TJ. Proteomics. 2015 Oct;15(20):3553-65.
  • A two-step database search method improves sensitivity in peptide sequence matches for metaproteomics and proteogenomics studies. Jagtap P, Goslinga J, Kooren JA, McGowan T, Wroblewski MS, Seymour SL, Griffin TJ. Proteomics. 2013 Apr;13(8):1352-7.
  • Reference values of fetal erythrocytes in maternal blood during pregnancy established using flow cytometry. de Wit H, Nabbe KC, Kooren JA, Adriaansen HJ, Roelandse-Koop EA, Schuitemaker JH, Hoffmann JJ. Am J Clin Pathol. 2011 Oct;136(4):631-6.
  • Evaluating the potential of a novel oral lesion exudate collection method coupled with mass spectrometry-based proteomics for oral cancer biomarker discovery. Kooren JA, Rhodus NL, Tang C, Jagtap PD, Horrigan BJ, Griffin TJ. Clin Proteomics. 2011 Sep 13;8:13.
  • Evaluation of the Ves-Matic Cube 200 erythrocyte sedimentation method: comparison with Westergren-based methods. Curvers J, Kooren J, Laan M, van Lierop E, van de Kerkhof D, Scharnhorst V, Herruer M. Am J Clin Pathol. 2010 Oct;134(4):653-60. 
  • Quantitative proteomics reveals myosin and actin as promising saliva biomarkers for distinguishing pre-malignant and malignant oral lesions. de Jong EP, Xie H, Onsongo G, Stone MD, Chen XB, Kooren JA, Refsland EW, Griffin RJ, Ondrey FG, Wu B, Le CT, Rhodus NL, Carlis JV, Griffin TJ. PLoS One. 2010 Jun 17;5(6):e11148.
  • Three-dimensional organization of gene expression in erythroid cells. de Laat W, Klous P, Kooren J, Noordermeer D, Palstra RJ, Simonis M, Splinter E, Grosveld F. Curr Top Dev Biol. 2008;82:117-39.

Alle publicaties van dr. J.A. (Jurgen) Kooren zijn beschikbaar via website: National Library of Medicine/National Institutes of Health

Terug naar boven